地積更正登記を行う際に、現況の面積を測りますが、
このとき、隣接者と境界の確認の下、地積測量を行わなければなりません。
また、境界標がない場合は、設置をしなければなりません。

地積更正登記の手続きの流れとして、

●法務局または役所に行き、登記や図面等のチェック
●隣接者立会いの下、測量
●境界標を設置
●図面作成
●必要書類をそろえて法務局に申請

といった流れになります。
個人でもできますが、間違いがあってはならないので、
専門家である土地家屋調査士に相談することをおすすめします。